Para fins de registro no programa, cálculo de DARF, etc como devo fazer esse registro de subscrição com final 11 ou final 13 até que haja a incorporação em si das cotas com final 11? Se eu deixar como 13 quando, e como devo fazer essa alteração?

Para cálculo do DARF a receita só precisa saber o quanto você lucrou, independente dos ativos que tenha negociado.

Você só vai precisar declarar os ativos que tinha em carteira no dia 31 de dezembro do ano anterior.

Portanto, se tiver utilizando algum programa que te ajuda nisso, lance com o final 11, como se tivesse comprado mais cotas.